Im Prinzip ist es möglich, aber es ist zu gefährlich.
Selbst Kenner verklicken oder vertippen sich mal und dann hast Du den Ärger.
Wenn Du sowas machen willst, dann solltest Du vorher ein Backup Image der kompletten Festplatte auf einen Datenträger machen, den Du während der Installation von Rechner getrennt aufbewahrst. Das Backup muss überprüft sein, ob es auch wirklich alles enthält.
Alternativ könntest Du die eigentliche Festplatte für die Dauer der Installation entfernen, dann kannst Du sicher sein, dass die Daten nicht angetastet werden, doch dabei besteht das Risiko, dass sie beschädigt wird, wodurch die vorhandene Installation ebenfalls vernichtet werden könnte. Außerdem besteht hier das Risiko, dass das Betriebssystem auf der USB-Platte nicht mehr bootet, sobald die eigentliche Festplatte wieder vorhanden ist, weil irgendeinen Gerätereihenfolge durcheinander gebracht wurde. Beim Versuch den Bootvorgang wieder zu korrigieren, könnte dann wieder das alte Betriebssystem beschädigt werden und bei jedem Update eines Paketes, das mit dem Booten zu tun hat, besteht erneut das Risiko, dass das alte Betriebssystem beeinträchtigt wird.