Meinst du damit, dass du die SuSE CD/DVD einlegst, dann installieren auswählst und der Installer die Meldet, dass es keine Platte gefunden hat. Und wenn du dann die CD/DVD wieder rausnimmst, dann startet ganz normal Windows.
Wenn dem so ist, fällt mir nur ein möglicher Fehler ein:
Die Festplatte ist die einzige im System, aber läuft als Slave. Ein modernes Bios und Windows haben damit nicht zwangläufig ein Problem, solange es wirklich nur eine Plattte ist. Aber ein auf Standartkonformität pochendes Linux-system wird da wahrscheinlich Probleme machen, weil die erste Platte ein Master sein muss. Außderdem sollte sie natürlich am Primary-IDE hängen.